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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
29/04/2015 |
Actualizado : |
15/10/2019 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
GRASSO, A.; GOLDBERG, V.; NAVAJAS, E.; IRIARTE, W.; GIMENO, D.; AGUILAR, I.; MEDRANO, J.F.; RINCÓN, G.; CIAPPESONI, G. |
Afiliación : |
ANDRES NICOLAS GRASSO PALAS, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; VIRGINIA GOLDBERG BIANCHI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ELLY ANA NAVAJAS VALENTINI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; WANDA IRIARTE GRECO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO GIMENO, SUL (Secretariado Uruguayo de la Lana).; IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JUAN F. MEDRANO, Universidad de California Davis (UCD); GONZALO RINCÓN, Universidad de California Davis (UCD); CARLOS GABRIEL CIAPPESONI SCARONE, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
Título : |
Genomic variation and population structure detected by single nucleotide polymorphism arrays in Corriedale, Merino and Creole sheep. |
Fecha de publicación : |
2014 |
Fuente / Imprenta : |
Genetics and Molecular Biology, 2014, v.37, n.2, p.389-395. |
DOI : |
10.1590/S1415-47572014000300011 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received: August 29, 2013 / Accepted: March 16, 2014. |
Contenido : |
ABSTRACT.
The aim of this study was to investigate the genetic diversity within and among three breeds of sheep: Corriedale, Merino and Creole. Sheep from the three breeds (Merino n = 110, Corriedale n = 108 and Creole n = 10) were genotyped using the Illumina Ovine SNP50 beadchip®
. Genetic diversity was evaluated by comparing the minor allele frequency (MAF) among breeds. Population structure and genetic differentiation were assessed using STRUCTURE software, principal component analysis (PCA) and fixation index (FST). Fixed markers (MAF = 0) that were different
among breeds were identified as specific breed markers. Using a subset of 18,181 single nucleotide polymorphisms (SNPs), PCA and STUCTURE analysis were able to explain population stratification within breeds. Merino and Corriedale divergent lines showed high levels of polymorphism (89.4% and 86% of polymorphic SNPs, respectively) and moderate genetic differentiation (FST = 0.08) between them. In contrast, Creole had only 69% polymorphic SNPs and
showed greater genetic differentiation from the other two breeds (FST = 0.17 for both breeds). Hence, a subset of molecular markers present in the OvineSNP50 is informative enough for breed assignment and population structure analysis of commercial and Creole breeds. |
Palabras claves : |
OVINE SNP50. |
Thesagro : |
DIVERSIDAD GENETICA; OVEJA; OVINOS; RAZAS (ANIMALES). |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/4414/1/Grasso-N.-2014.-Genetcs-and-Mol.Biol.v37n2.pdf
http://www.scielo.br/pdf/gmb/v37n2/a11v37n2.pdf
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Volumen
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Estado
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha actual : |
23/10/2015 |
Actualizado : |
30/05/2018 |
Tipo de producción científica : |
Documentos |
Autor : |
BENÍTEZ, M.J.; BERTONI, E.; BERTALMIO, A.; RUBIO, L.; RIVAS, C.; MAESO, D.; COLINA, R. |
Afiliación : |
MARÍA JOSÉ BENÍTEZ, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía - Regional Norte (Salto); ESTEFANY BERTONI, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía - Regional Norte (Salto); ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; LETICIA PAOLA RUBIO CATTANI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO CESAR MAESO TOZZI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODNEY COLINA, Universidad de la República (UdelaR)/ Facultad de Agronomía - Regional Norte (Salto). |
Título : |
Detección y caracterización de virus y viroides en la Citricultura del Uruguay: aportes sobre el nuevo linaje de CTV en Sudamérica y su repercusión en la protección cruzada. |
Fecha de publicación : |
2015 |
Fuente / Imprenta : |
In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Citrícola. Resultados de investigación en Citricultura: Genética, Sanidad, Productividad. Salto (Uruguay): INIA, 2015. |
Páginas : |
p. 107-112 |
Serie : |
(Serie Actividades de Difusión; 752). |
ISSN : |
1688-9258. |
Idioma : |
Español |
Thesagro : |
CITRUS; ENFERMEDADES VIRALES; VIROSIS. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/9914/1/SAD-752.-p.107-112.pdf
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Marc : |
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